En el mes de noviembre de 1998, la Universidad Tecnológica Santa Catarina inició las actividades para desarrollar, implantar y obtener la certificación del Sistema de Gestión de la Calidad de la Universidad Tecnológica Santa Catarina, de acuerdo con la Norma ISO-9002:1994 y la Norma Mexicana NMX-CC-OO4:1995.

Las estrategias institucionales más relevantes para lograr implantar el Sistema de Gestión de la Calidad fueron: el compromiso del Rector con la calidad, el trabajo en equipo y la selección del mejor equipo de asesores de calidad.

El logro principal fue  la certificación del Sistema de Gestión de la Calidad de la Universidad Tecnológica Santa Catarina el 16 de diciembre de 1999, por parte  del Organismo Nacional de Certificación CALMECAC, quien expidió a la Universidad el Certificado No. 298266.

Dentro de las estrategias institucionales del Programa Integral de Fortalecimiento Institucional, el día 27 de noviembre de 2003 se logró la transición a la Norma ISO 9001:2000 y el 25 de mayo de 2010 se logró la transición a la Norma ISO 9001:2008.

El alcance comprende el proceso de enseñanza-aprendizaje y sus áreas de apoyo relacionadas: Administración y Finanzas, Vinculación, Servicios Escolares, Mediateca y Planeación y Evaluación.

Los beneficios que se obtuvieron fue formar un equipo de trabajo y establecer un sistema formal de calidad, con documentación ágil y consistente, con roles y responsabilidades claras y con miras a dar cumplimiento a expectativas de alumnos, maestros, empresarios y sociedad en general.

El Consejo Nacional para Prevenir la Discriminación, con fecha 12 de junio de 2009, con fundamento en el Artículo 85 de la Ley Federal para Prevenir y Eliminar la Discriminación y de conformidad con lo establecido en el Artículo 40 del Estatuto Orgánico del Consejo Nacional para Prevenir la Discriminación, otorgó a la Universidad Tecnológica Santa Catarina el Reconocimiento por la Cultura de la No Discriminación.

Los Comités Interinstitucionales para la Evaluación de la Educación Superior, en los meses de mayo y junio de 2009, Clasificó en el Nivel 1 a los siguientes programas académicos: Técnico Superior Universitario en Tecnologías de la Información y Comunicación, Área Sistemas Informáticos; TSU en Mecánica Industrial; TSU en Electrónica y Automatización; TSU en Procesos de Producción y TSU en Mantenimiento Industrial.

Está en trámite la certificación de estas carreras ante el Consejo de Acreditación de la Enseñanza de la Ingeniería (CACEI), organismo acreditador reconocido por el Consejo para la Acreditación de la Educación Superior, A.C. (COPAES).